在燃烧室内充分燃烧后，被受热面吸收大部分热量后，高温烟气进入对流受热面进行换热，出燃生物质蒸汽发生器后，在空气预热器中加热燃烧所需空气，再经过除尘器由引风机将烟气送至烟囱排入大气中。

有效降低燃生物质蒸汽发生器的运行成本，就需提升整体运行热效率，降低排烟温度，随着温度的降低，热损耗也会下降。想要让生物质蒸汽发生器排烟温度达到更理想的降低效果，可以在尾部增加受热面积，可加设烟气预热器、预热水箱。若尾部排烟温度过低，并达到烟气露点温度，就会让烟气中的二氧化硫等其他成分凝结在烟气预热器表面上，形成低温腐蚀。

若采用含硫量多的燃料燃烧，低温腐蚀会更严重，生物质蒸汽发生器排烟温度高低需相应技术经济比较后才可确定，对大吨位而言，排烟温度应控制在110°至106°。

温度偏高，会影响整个运行经济性的发展，每升高10℃，排烟损失就会增加0.5至0.8，造成排烟温度升高的原因主要因为，漏风、制粉系统运行情况、受热面积、环境大气温度高等多重原因，还可能因为入炉煤质情况、温度测点测量误差而产生影响。

漏风是炉膛或烟道出现漏风情况，是排烟温度升高的一大主要原因，当出现这种问题时，也说明生物质蒸汽发生器的运行管理、检测、设备构造方面出现了问题，炉膛漏风主要因炉顶密封、看火孔、人孔门、炉底密封水槽位置出现漏风，烟道漏风主要在氧量计前尾部发生这种情况。